企业研发费用归集的常见问题集中在 “范围界定不清、项目归属混乱、凭证支撑不足、数据逻辑矛盾” 四大类，直接影响高企认定通过率，具体如下：

一、范围界定错误：混淆 “研发” 与 “非研发” 费用

1. 把生产经营类支出计入研发费用，比如生产车间设备折旧、常规产品检测费、生产线改造费、员工通勤福利等。

2. 超范围归集其他费用，如业务招待费、差旅费（非研发相关）、营销推广费等混入 “其他相关费用”，且未控制在总研发费用 20% 的上限内。

3. 委托外部研发费用归集违规，未按实际发生额的 80% 计入，或无完整委托合同、成果归属证明，甚至将委托生产加工费误判为研发费。

二、项目归属混乱：无明确对应研发项目

1. 费用未绑定具体研发项目，存在 “无项目归集” 或 “多个项目混排费用” 的情况，无法区分各项目的费用构成。

2. 共用设备、场地的费用分摊无依据，未按研发使用时间、工作量等合理比例分摊，或分摊标准前后不一致。

3. 研发项目起止时间与费用发生时间不匹配，如项目未立项却提前归集费用，或项目已结题仍持续归集费用。

三、凭证与台账支撑不足：无法验证费用真实性

1. 凭证未标注研发用途，如采购材料的发票无 “研发专用” 备注，领料单无研发项目负责人签字，工资表未明确研发岗位人员。

2. 未建立规范的研发费用辅助账，或辅助账与会计账簿、原始凭证脱节，明细信息不全（如缺少凭证号、费用类别模糊）。

3. 外聘研发人员、专家咨询费等无合规凭证，如未签订劳务合同、付款凭证与费用金额不一致，缺少服务成果说明。

四、数据逻辑矛盾：多材料数据不一致

1. 研发费用总额与财务报表、专项审计报告、纳税申报表数据冲突，且无差异说明。

2. 境内研发费用占比未达标（低于 60%），或未单独统计境内外研发费用，导致归集口径不符合高企要求。

3. 科技人员人工费用与科技人员名单不匹配，如工资表中的研发人员未列入科技人员清单，或人数、薪酬与社保缴费凭证矛盾。

五、其他常见疏漏

1. 无形资产摊销年限不符合规定，或研发专用软件、专利等未按实际使用情况摊销。

2. 失败研发项目的费用被随意剔除，未计入总研发费用（失败项目费用可正常归集）。

3. 研发费用辅助账未及时更新，与年度财务核算不同步，导致后续审计时无法追溯调整